В настоящее время существует немало «теорий полиграфа», с разной степенью успешности объясняющих феномены динамики вегетативных реакций, наблюдаемых в ситуации ПфИ. К сожалению, многие из них сведены к простому описанию механизмов возникновения значимости или вегетативных реакций, связанных с эмоциями, вниманием и проч. Однако, более пристальный взгляд на «теории полиграфа» позволяет убедиться в том, что все эти концепции имеют единое происхождение и наиболее органично могут быть объяснены в парадигме Теории целенаправленного тестирования памяти [21].

Так, например, более сильные эмоции вызовет стимул, несущий информацию о событии прошлого, запечатлённом в памяти исследуемого лица. Больше внимания привлечёт стимул, связанный с событием прошлого, при условии, что в памяти у человека будет информация о таком событии, чем какой-то другой стимул. В соответствии с положениями Теории угрозы наказания [21, с. 62-64], бо́льшую угрозу для исследуемого представляет стимул, содержащий в себе информацию, соответствующую информации в памяти и меньшую угрозу, если в памяти такая информация отсутствует. Бо́льший личностный смысл приобретает тот стимул, смысл которого связан с имеющейся в памяти информацией. Даже если описывать результат «детекции лжи» с помощью полиграфа в терминах Американской ассоциации полиграфологов – «ложь обнаружена/не обнаружена» – не корректных для психофизиологии, то, очевидно, что ложь возможна только как процесс искажения имеющейся в памяти информации. Фактически, все эти, казалось бы, разные воззрения, являются лишь взглядом с позиций различных подходов на одно и то же явление – на системообразующий фактор наличия или отсутствия в памяти информации об интересующем событии прошлого.

Таким образом, можно сформулировать следующие общие представления о принципах корректно проводимого психофизиологического исследования с применением полиграфа:
1. Динамика вегетативных реакций подчиняется «закону силы»: чем сильнее раздражитель, тем сильнее ответ организма.
2. В ситуации применения полиграфа наблюдаются разные по силе реакции, что является частным проявлением «закона силы».
3. Сила реакции зависит от психической характеристики стимула – значимости.
4. Если существуют разные по силе реакции, то, следовательно, их вызывает разная по силе значимость.
5. Информация о значимости стимула извлекается из памяти.
6. Разную по силе значимость формируют разные характеристики памяти.
7. Характеристиками памяти является хранящаяся в ней разнообразная информация.
8. Память «причастного» лица имеет особую характеристику – наличие информации об интересующем событии прошлого. У «непричастного» такая характеристика отсутствует.
9. Наличие информации об интересующем событии прошлого является той характеристикой, которая формирует бо́льшую значимость стимула.
10. Наличие или отсутствие информации в памяти об интересующем событии прошлого вызывает сильные или слабые реакции на стимулы разных категорий.